首相は同日朝、首相公邸前で記者団に対し、小林氏の進退に関し、「これで終わったと思っていない。何らかの対処をする必要がある」と強調した。
これに対し、小沢氏は「首相がどういう意味でおっしゃったか知りませんが…」とした上で、党として小林氏の進退に関与しない考えを表明。実際、同日の党役員会や常任幹事会でも、小林氏の問題が取り上げられることはなかった。
首相は同日夜、首相官邸で記者団に対し、小林氏の件で小沢氏と電話で協議したと説明。その上で「小沢氏との（話の）中で、『これは北海道のことだ』ということなので、北海道連代表の三井弁雄（わきお）国対委員長代理と相談することになった。三井氏は『自分にしばらく任せてくれ』と（言った）」と述べ、その方針を容認する考えを示した。
首相は、産経新聞のインタビューで小沢氏の党運営を批判した生方（うぶかた）幸夫副幹事長についても１９日、「党の外でさまざまな声を上げるとなると、党内の規律が守れない」と指摘し、解任を決めた党執行部の方針を支持していた。
しかし小沢氏は２３日、生方氏の続投を決定。首相は「副幹事長の人事はすべて幹事長が行う。（生方氏が続投することで）党の中でしっかり議論するということになるので、むしろ良かった」と述べた。
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